万州属于长江的上游。
万州区植物有99科、255属、505种，其中裸子植物7科、15属、24种，被子植物92种、240属、505种，主要树种为马尾松、杜鹃、黄荆等
万州在长江上游，长江上中游的分界线是宜昌，中下游的分界线是湖口，长江源头至湖北宜昌市为上游，万州位于重庆、都属于长江的上游。长江干流自西而东横贯中国中部，数百条支流辐辏南北，延伸至贵州、甘肃、陕西、河南、广西、广东、浙江、福建8个省、自治区的部分地区。流域面积达180万平方公里，约占中国陆地总面积的1/5。淮河大部分水量也通过大运河汇入长江。
长江上游河段西起青藏高原各拉丹东，东至湖北宜昌，全长4511公里。该段干支流流域覆盖面积宽广，包含青藏高原，东至湖北宜昌，北到陕西南部，南至云南以及贵州北部的广大地区，涉及重庆、西藏、四川、青海、云南、贵州、甘肃、陕西、湖北等多个省、自治区、直辖市。
长江流域是全国七大江河流域中最大的流域，其国民生产总值约占全国的36%。长江上游地区是我国西部大开发的重要地区。
万州是在长江上游地区，万州是建设中的重庆第二大都市，长江十大港口之一，重庆第二大城市和三峡库区最大的中心城市，万州被确定为全国179个国家公路运输枢纽城市之一。上距重庆327公里，下到宜昌321公里。长期以来，万州是渝东、鄂西、陕南、川东的物资集散地和长江三峡黄金旅游线的必经之地。随着三峡工程的建设，2003年6月二期蓄水和移民迁建，万州在三峡库区的地位日益凸现。特别是机场、铁路 、渝万高速公路、深水码头的相继竣工使用，使万州逐渐成为新三峡旅游的进出口和库区旅游的服务中心。
