二者的主要区别如下：
第一、成分及原料不同：有机钙通常是以动物脊椎骨为原料，主要成分包括C12H22CaO14•H2O，C₆HCaO₆，(CH3COO)2Ca·H2O等；无机钙主要有碳酸钙、磷酸钙、氯化钙等，多以动物贝壳、石灰石、大理石、石膏、珍珠、牡蝠为原料。
第二、来源不同：有机钙是从植物中提取的柠檬酸钙的来源；而无机钙则是根据化学实验在矿物中提取出来的产物。
有机钙是钙的有机化合物，无机钙包括一切无机钙的钙盐，有机钙大多数具有生物活性，易于人体吸收，如柠檬酸钙，乳酸钙，葡萄糖酸钙，化学式CHCa3O，C6HCaO6，CHCaO•H2O，而无机钙如碳酸钙，氯化钙，磷酸钙盐等，无机钙人体吸收率极低
