油性马克笔和水性马克笔主要区别在于它们的油墨或水墨成分不同。
油性马克笔使用的是油墨，因此颜色比较鲜艳饱满、干燥速度较慢、对透明或亮面材质表现良好，但干后颜色会变深。常用于写黑板报，玻璃、金属等表面上。
水性马克笔使用的是水墨，通常沾水能擦掉。因此干燥速度快，书写时手感柔顺、色彩清新明亮，但不耐水、抗刮擦性稍差些，而且对于一些材质（如塑胶）会起毛边。
两种马克笔使用范围不同，每个人根据自己的需求选择即可。如果需要书写字迹流畅、快速干燥并且需要长时间保存，则建议选择油性马克笔；如果需要颜色清新、对环境污染影响小并且可以轻易清除，则建议选择水性马克笔。
