一、首先解决“研究什么”的问题，是科研工作成败的关键，也是科学研究的第一步，是直接关系到能否取得成果的前提，爱因斯坦也曾指出 “提出一个问题往往比解决一个问题更重要，因为解决问题也许仅是一个数学上或实验的技能而已，而提出新的问题，却需要有创造性的想象力，而且标志着科学的真正进步”。
二、基金申请成败关键在于选题，并阅读这年中申请科学基金项目的指南，了解重点与优先领域，以确定选题范围。国家自然科学基金的属性是坚定不移地支持基础研究，着力源头创新，为科技、经济和社会发展提供源源不断的成果和人才储备，注重创新，为科技发展提供后劲，主要资助针对我国经济、社会、科技发展需求的基础研究和具有重要价值，原始创新项目。
三、选题应遵循原则有：需要性原则，选择有重大意义或急需解决的问题;目的性原则，目标集中，不含糊，不笼统;创新性原则，针对科学而言，没有地域性;先进性原则，针对技术而言，有地域性;科学性原则，有依据(A+B=C)，符合客观规律，设计科学;可行性原则，主要技术指标实现的可能性;效能性原则，社会效益、经济效益、应用价值等。
四、选题最好以问题为导向，不要以技术为导向，找到问题了，课题就找到了，而拿着新技术去找能解决的问题，效果多数不好，但还是大有人在，比如RNAi。多方法多学科交叉一般都会比较受人青睐，但不能为了交叉而强行交叉。创新性新技术、新理论的课题要有一定的理论与技术基础，最好有工作基础，切忌东拼西凑，空中楼阁。基金申请项目应选择自己熟悉，有基础研究，能发挥本人学术优势的项目，别跨越太大。

①可以选择热点话题，但避免有争议和敏感的话题
②选择自己擅长的话题
③选择有创新性的话题
