游戏的结局就2个，分歧点在第5章，裁判最后揭不揭发雾切，不揭发会进入第6章，揭发则BAD END然后回到学级裁判。此外当学院裁判里做出错误的判断导致犯人没有被发现游戏将结束，主角会死，也算是BD了。
第一种是死了好多人之后打败江之岛的he 。第二种是说了太多错误证据被行刑be 。第三种是伪结局，大家都生活在一起，不杀人，也不出去了，还有了孩子 。第四种，在小说里才有的，苗木扭到了脱出装置，全员脱出。
GOOD END则是最后打败大boss江之岛盾子，然后走出学院，这个算是真结局。
还有一个被称之为“隐藏结局”的，在一周目结束后去EXTRA的SCHOOL STORE中可以以一定概率得到92号礼物“逃脱开关”，持有这个的情况下去看EXTRA的MOVIE栏，会多出最后一个MOVIE“大家再见绝望学园”。这个只是一个全员脱出的映像CG而已。
