在中国，食用畜禽肉、禽蛋类较多，多年来一直以沙门氏菌食物中毒居首位。鱼、虾蟹、贝类和海藻等所造成的中毒多是副溶血性弧菌食物中毒。
常见的有以下几类污染：
细菌性污染：常见的有沙门菌、变形杆菌、肉毒杆菌、金黄色葡萄菌等，主要污染食品为变质的肉、蛋、奶、豆制品、发馊的饭菜或冷饮；而肉毒杆菌污染的是火腿、腊肉、罐头、臭豆腐等。
霉菌性污染：常见的有黄曲霉毒素等，污染的食品主要为霉变的米、麦、花生、玉米等。
寄生虫性污染：常见的有绦虫污染的猪肉、牛肉，姜片虫和肺吸虫的卵，囊蚴污染的荸荠、蟹、虾等。
病毒性污染：常见的有甲型肝炎病毒污染的毛蚶。
农药残留：包括谷物、蔬菜、水果、蛋、奶、肉等食品中残留的有机磷农药、有机氯农药、有机汞农药等。
亚硝胺类化合物污染：腌渍食物如腊肠、火腿、腌菜等。
辐射污染。
