神舟12空间站内部构造（神舟12号与天和核心舱对接图片）

神舟十二号沿用了之前神舟飞船所采用的三舱结构布局，由轨道舱、返回舱和推进舱组成，这三个部分有着各自不同的功能。

返回舱：飞船控制区、 航天员工作区，中间的有点像中倒扣金钟的这个位置是飞船的返回舱，它也是飞船的控制区或者航天员的工作区。航天员在起飞段、降落段以及进行手控的交会对接的所有的工作都要在这里完成。

三个舱段在神舟飞船独立飞行期间各司其职，分别承担不同的工作，而当神舟飞船与空间站对接形成组合体后，舱段的分工将会有所调整。