知柏地黄丸与杞菊地黄丸可以通过组成、治疗的功效上区别。知柏地黄丸的功效是清虚热,主要治疗体虚内热引起的腰膝酸软、骨蒸潮热、遗精遗尿等症状。杞菊地黄丸主要功效是清肝明目、养阴;主要治疗由肝肾阴虚导致的头晕眼花、目眩、盗汗等症状。