高等专科学校与职业技术学院的区别在于学历层次和培养方向不同。
高等专科学校是以高中毕业生为主要招生对象，培养具备一定专业技能的中等专业人才，学历层次为高等教育专科层次；而职业技术学院是以中职、高中毕业生为主要招生对象，注重实践性技能培养，学历层次为高等职业教育层次。
此外，高等专科学校的教育目标在于培养应用型人才，注重学生的实践能力和职业素质的培养，对后续学习和职业发展具有较好的铺垫；而职业技术学院的教育目标则更加注重学生的职业技能培养，帮助学生快速适应企业需要，直接进入社会工作。
从名字上看，“学院”和“学校”就有很大不同。高等学校也就是我们常说的大学，无论是专科还是本科，都属于综合性的学校，无论学校名字里是理工还是师范，学校内都会有各专业所设立的学院。也就是说学校里是包含多个学院的。
而“学院”内学科专业设置相对单一，有些独立的学校也成为“学院”，有些是隶属于其他某个重点大学中的独立学院。
