新鲜香菇必须避免在强光下保存。
必须避免在强光下贮存香菇，同时也要避免用透光材料包装。密封贮存法 可用铁罐、陶瓷缸等可密封的容器装贮香菇，容器应内衬食品袋。要尽量少开容器口，有条件的可用抽氧充氮袋装贮。
香菇存放时应确保密封，不要空气接触以免软化，避开高温及日晒处，放在阴凉的地方，用较厚的塑胶袋小包装存放。 受潮再烘干或日晒保存香气及口感。生鲜未烘干之香菇避免沾水，可延长保存期限。
将生鲜香菇放入冰箱之冷冻库存放，亦可延长保存期，使用前解冻即可，但不可反复冷冻。香菇必须在低温通风处贮存，有条件的可把装香菇的容器密封后置于冰箱或冷库中贮存。香菇含水量高时容易氧化变质，发生霉变。
