1、陶器密封
做好的熏鱼可以用陶器保存，将做好的熏鱼放入陶器里面后，用干净的布盖住容器口，再把木板盖在上面，之后找一个干燥的地方铺上6～7厘米生石灰，将缸压在石灰上，可使熏鱼的保质期延至4个月以上。
2、冰箱保存
做好的熏鱼还可以放入冰箱保存，用保鲜袋将熏鱼包裹好后，直接将熏鱼放入冰箱保鲜层保存，也可以将熏鱼保存很长一段时间，熏鱼不容易出现变质的现象，但是需要注意做好的熏鱼越早食用，其风味越好。
3、草灰覆盖
做好的熏鱼也可以先用纸包裹好，再把熏鱼放入箩筐或者是纸箱内，之后每放一层熏鱼，上面就覆盖一层稻草灰或麦草灰，最后用木板盖住筐口并放在干燥通风的地方，可以将熏鱼保存半年以上。
