日本的民族构成比较单一，但不能简单地将其称作“单一民族国家”。所以这样说，是因为日本列岛上除了人们熟知的“大和人”以外，还生存和繁衍着别具民族特征的阿依努人和琉球人。
1、大和人亦称“和人”，是日本民族的主体，约占总人口的98%以上。大和人属蒙古人种东亚类型，其系统特征是头较短，黄皮肤，黑头发，体毛和胡须较少。耳垢为干性。眼睑中有被称作“蒙古襞”的皱襞。血型以A型居多，其他依次为O型、B型、AB型。
大和人原来身材较矮。近年来，大和人的平均身高已有明显增加。据统计其男人的平均身高已达170厘米左右，在世界上属于中上水平。
2、阿依努人旧称“虾夷人”，属于千岛人种类型。在体形上，阿依努人具有蒙古人种的基本特征，略微兼有赤道人种的某些特征：肤色黑黄。体毛浓密，腿长腰阔，
头大颧高。他们不仅拥有自己的语言——阿依努语，而且还具有独特的文学和独特的音乐和舞蹈。阿依努人信奉一种带有浓厚的萨满教色彩的宗教，经常举行“熊祭”、“鲸祭”等宗教仪式——这与他们自古以来一直过着以渔猎、采集为主要生存手段的自给自足的生活有密切联系。到了现代，阿依努人的上述民族特征已经所剩无几，处于被和人逐渐同化的过程之中。
但是，同化现象的出现并不等于阿依努民族的消失。据统计，还约有2.5万阿依努人集中生活在北海道的胆振、日高等地。
3、琉球人目前约有120万人，绝大部分生活在日本冲绳县所在地——琉球群岛。琉球人虽然与大和人同属蒙古人种，但与大和人相比，他们的身材略矮，眉毛较浓，颧骨稍高。古代琉球人以部落为单位群居，14世纪时建立了三个小国，1429年由尚巴志统一为琉球王国，与中国结成朝贡册封关系。17世纪初遭日本萨摩藩侵略并开始受其控制，1879年，琉球被正式纳入日本版图。
