目前医学上仍没有找到口腔溃疡的具体病因。有学者提出跟环境、免疫、生活习惯等因素有关。环境包括心理环境、工作环境、自然环境。如持续紧张、工作压力大、气候湿热等;过度烟酒、长期睡眠不足等引起免疫系统的应激性反应，也可能造成口腔溃疡;喜好刺激性食物、喝水少、口腔卫生差等原因也可能引起。
一般的口腔溃疡都会自动痊愈，如果是疼痛无法忍受的情况，可到医院进行消炎止痛处理。同时注重口腔卫生维护，饭后用漱口水或淡盐水漱口，减少食物残渣滞留。此外，应保持良好的心态和积极的生活态度，保持良好的生活习惯，早睡早起，加强锻炼，注重营养均衡。
总是起口腔溃疡，是复发性的口腔溃疡，病因比较多，发病的机制并不是非常明确，诱因可能是局部创伤、精神心理压力、紧张以及缺乏维生素、微量元素、药物的作用、激素水平的改变或者系统性疾病，包括胃溃疡、十二指肠溃疡、糖尿病、遗传因素，还有占比较大比重的免疫方面的因素，包括免疫异常，还有内分泌的原因。
