办学机构不同，公办本科院校是由当地的财政部门进行统一拨款，师资力量更加雄厚，而民办本科一般都是由企业或者一些民办人士进行创立，师资力量可能不那么雄厚，但是针对性较强。
学历的认可度不同，公办本科院校一般为一本或者二本学校，在社会上的认可度比较高，特别是一些一本类的985或者211学校，民办院校一般为二本或者三本类院校，在社会上的认可度相对要低于公办院校
二者区别如下：
一是举办者不同，民办本科举办是个人或社会机构，公办是国家举办；
二是经费来源不同，民办是自筹，公办是财政拨款；
三是管理形式不同，民办一般设董事会，公办由政府教育行政部门管理；
四是录取分数不同，民办属二本批次较低分数，公办录取分数高于民办。
