故事大概讲述了一家极具势力的公司，从事危险生化研究，一部分人想要盗取药剂，却不小心打碎了病毒，使得大范围扩展，底下研究院变成了人间地狱。女主爱丽丝是此公司员工，失去记忆，和这家公司派出的小队进入了这里，发现情况比想象的更严峻，她在这里结实了好朋友，失去也看透了拥有婚戒的男友，AI红后想将病毒永远关闭在地下，与亦正亦邪的AI与怪物们斗争，最终和马克两人逃出地底，却被公司抓去做了研究。
她们一个成了融合了T病毒的生化人，一个成了怪物，马克失去了记忆，被公司控制，由于公司打开了地下城，病毒扩散，整个城市沦为死城，城市会被清理。于是女主一行人救了研究员的女儿想要通过研究员逃离这里，同时也知道了T病毒的初衷是为了使体弱的女儿重新站起来才研制的，没想到会被用于生化实验。最终逃离抢夺飞机的时候，马克恢复了记忆，与公司派出的小队同归于尽，女主她们逃离活了下来。
但是病毒继续恶化了，使城市逐渐沙漠化，而公司对女主爱丽丝的监视和捕捉从没有停止，邪恶的研究员甚至不断克隆爱丽丝，并杀死她们做研究，但克隆人并没有爱丽丝本人强大。女主听到广播里有一处未被感染的地方，送伙伴们上了飞机前往，自己却深入底下城报仇，研究员成了强大的怪物，克隆爱丽丝和爱丽丝共同打败了怪物，并继续复仇。
