花椒油用密封瓶装好密封，可将花椒油瓶放在通风良好的避光处，同时保证温度不要过高。也可放入冰箱保鲜层保存，温度不过低。两种方法都可使花椒油保存12个月不变质。
只要注意避光，放在室温下也可以保存12个月不变质。但是，花椒油里含有香味物质具有挥发性，保存时间越久则香味流失越多，注意密封也是关键。
保存花椒油之所以需要避光，是因为油脂类的东西在光照的情况下容易分解，从而产生难闻的“哈喇味”，这样的油脂就不能再吃了。因此，短期保存花椒油，只需要放在常温下，拧紧瓶盖避光保存就可以了。长期保存花椒油尽量还是放在冰箱的冷藏室里比较好。
