柠檬的品种很多，但适合盆栽的主要有以下几种：
(1)尤力克，又称油力克、油利加。果顶有明显的乳头状凸尖，果皮较粗糙，间有纵棱，皮厚，果肉甚酸。来自美国。耐寒性略弱，但养分和环境条件好的情况下，春(5月)、夏(6—7月)、秋(9—10月)都会开花结果。
(2)里斯本。耐寒，来自葡萄牙，是柠檬中最耐寒的品种。枝条容易向上伸展，且树势茂盛，易长成大树，所以修剪是主要工作。果顶有较长的乳头状凸尖且常稍向一侧弯斜，果皮较光滑，果基也有较明显的颈部，果肉酸味甚浓。
(3)维拉法兰卡。来自意大利，刺较小且少，修剪时不用担心被扎到。枝条容易向上伸展，但量不多，比较容易修剪。耐寒性略强。
(4)中国柠檬。是柠檬与橘子的杂交种。酸味比柠檬柔和、略带甜味，果皮薄。比纯种柠檬耐寒，刺也较少，易栽培。
手指柠檬是一种果实小而细长的果实，看起来就和小手指一般，它的果肉形态就是很可爱的，植株并不会太高大，可以栽种在花盆中。手指柠檬现在已经成为烹饪界特别受欢迎的一种美食，可以说是供不应求。手指柠檬是一种非常小型的柑橘水果，植株小巧，果实更是特别精致，它的果肉里面是饱含汁液的，就像是鱼子酱一般。
