第1096集——《你上当了》。在柯南等人的面前，白鸟任三郎警部乘坐的车爆炸了。虽然勉强保住了一条命，但却是重病的天鹅。那只手上握着一封信。和7年前和3年前发生的炸弹事件相同，犯人的内容可以说是向警察发出的挑战书。记载的暗号显示了东京设置的两颗炸弹的所在。
为了逮捕犯人而奋起的佐藤美和子刑警。美和子驾驶的车里有柯南，高木涉刑警的车里有灰原哀，圆谷光彦，吉田步美，小嶋元太，询问了关于过去炸弹事件的详细情况。过去的炸弹事件的犯人有两人，一人在警察的追踪下因事故死亡，似乎对警察怀有怨恨。
想方设法解开暗号，搜查员们前往那个地方……。
