其实海水和普通水一样是无色透明的，而我们看到的蓝色大海是海水对太阳光线的吸收、反射和散射造成的。
太阳光是由红、橙、黄、绿、青、蓝、紫七色光复合而成，波长由长渐短，其中波长长的红光、橙光、黄光穿透能力强，最易被水分子所吸收，而波长较短的蓝光、紫光穿透能力弱，遇到纯净海水时最易被散射和反射。而人类眼睛对紫光很不敏感，往往视而不见，对蓝光比较敏感，于是我们所见到的海洋就呈现出一片蔚蓝了。
而湖水之所以为绿色，是因为湖泊的面积较小、深度浅，不足以吸收掉绿光。而海水的深度深，可以吸收绿光而反射蓝光，所以它们的颜色不同。加上湖水里和周围多生长树木等绿色植被，在这样的映衬下湖水就多为绿色了。另外湖水中含有大量藻类，这些藻类多呈绿色，如绿藻等，加上一些河水污染严重，导致富营养化，藻类数量大大增加，越发呈现绿色了。
总之，海水和河水的深度不同，使得照射进水里的光被吸收和被反射光波不同，所以颜色会不同。
海水是蓝色的原因：选择吸收是物体呈现颜色的主要原因。
在一定的波长范围内，若物质对通过它的各种波长的光都作等量（指能量）吸收，且吸收量很小，则称这种物质为一般吸收；若物质吸收某种波长的光能比较显著，则称这种物质具有选择吸收性。
太阳光照射到海面时，一部分光被反射回来，另一部分光折射进入水中。
进入水中的光线在传播过程中会被水吸收。
水对光的吸收与光的波长有关，即水具有选择吸收性。
水对波长较长的光吸收显著，对波长较短的吸收不明显。
红光、橙光和黄光在不同的深度时均被吸收了，并使海水的温度升高。
到一定的深度绿光也被吸收了。
而波长较短的蓝光和紫光遇到水分子或其他微粒会四面散开，或反射回来。
所以当海水明净清澈时，目光中被海水吸收最少的蓝光和紫光就反射和散射到我们眼里，我们看见的大海就呈现出蓝色 河水绿色是因为河水中有进行光合作用的藻类,所以是绿色
