两层农村自建房的楼梯是否需要通到顶，取决于房屋的设计和用途。
一般来说，如果自建房是两层，且设计为上下两层独立的空间，那么楼梯可以只连接上下两层，不需要通到顶。在这种情况下，楼梯通常位于房屋的中心或侧面，方便人员上下，同时不会占用太多的室内空间。
然而，如果自建房的二楼设计为一个大空间，例如一个大客厅或开放式厨房等，那么楼梯可能需要通到顶，以便从一楼直接进入二楼的大空间。在这种情况下，楼梯可以设计为L型或U型，以提供更大的空间利用率和更好的视觉效果。
总之，楼梯的设计取决于房屋的具体情况和使用需求。如果需要更具体的信息和建议，建议咨询专业的建筑设计师或工程师。
