选择长势良好，根系发达的疯长辣椒植株，将辣椒茎基保留，用剪刀在辣椒每个分叉5厘米处，将分叉茎基5厘米以上的枝叶按照斜45度角全部剪除，且每株主干上只能保留四个或四个以下的分叉，每个分叉枝干保留的茎基最少存在一个腋芽。
疯长枝条剪除后，使用50%的多菌灵500倍液与农用链霉素一支与20%的病毒A可湿粉剂搭配成混合溶液，对修剪辣椒茎秆茬口涂抹，防止病虫害菌核虫卵从修剪茬口侵染。
在辣椒生长的早期，就应该对它进行修剪了，修剪的时候可以使用小剪刀或是用手直接掐掉。在修剪之前应该注意对工具进行消毒处理，防止病毒和细菌在不同的植株间传播。
当辣椒苗长到一尺左右高的时候，就可以对它进行打顶了。在保存几片叶子的基础上，修剪植物的上半部分，并将多余的叶子修剪掉，这样可以让辣椒苗生长的更好。到了生长后期，就尽量不要再修剪它的叶子了，合适的叶子可以让它更好的进行光合作用。
辣椒植物如果长势较好，等到辣椒开花后应该将最初的几朵花剪掉。
