辣椒苗是不需要掐顶的；因为辣椒苗长到8一12片真叶时，自己就会劈头，也就是由一个头变成三个头，所谓的门椒就是劈头时所结的第一个辣椒，接着就会又由三个头变成六个、九个、十二个等，辣椒也会随着辣椒树头的增多而增多；所以，辣椒种植是不需要人为地掐顶的。
要掐顶，当辣椒植株长到16厘米左右，就可以掐了。在掐辣椒尖时，可将辣椒顶端的枝芽去掉，以去除其顶端优势，促进辣椒植株的侧枝生长。
摘心后，辣椒要进行第二次修剪，即当侧枝生长到一定阶段时，需要去除侧枝顶端的芽，剪去部分密集枝和枯枝，以减少营养消耗，促进侧枝萌发生长。
