在羊肚菌的出菇期间，我们还需要加强通风管理，保持出菇房中的空气流通。出菇房的通风时长主要和天气变化和温度变化有关。像天气比较干燥、温度较高、天气较好的情况下，那么出菇房的通风时间就可以适当的延长。但如果是低温天气，或者是多雨天气，那么通风时长最好控制在两个小时左右。最后就是如果出菇房的湿度过大，我们也要及时的实行通风，降低湿度，促进出菇。
在大棚内进行羊肚菌种植时，需要经常进行通风、降温、以及加湿处理，在传统的大棚内进行降温处理时，通过向棚顶上覆盖一些遮阳物进行降温，降温效果不是很明显，进行通风透气处理时，将大棚的两侧或者棚顶打开进行通风，虽然能够增加空气的流通，但是容易使羊肚菌根部的泥土和空气变得干燥，不利于羊肚菌的正常生长，还需工作人员进行洒水，增加了工作人员的工作负担。
