方舟孤岛的故事：
海伦娜是一个现代生物学家(的克隆体，但她当时并不知道，后面人物都如此)，她在孤岛结识了近代化学家罗克韦尔，两人发现了神器和方尖碑的联系。海伦娜用神器激活了方尖碑，结果招出了蜘蛛BOSS，坑苦了友方部落。打死蜘蛛掉落了一把钥匙，海伦娜觉得钥匙和某秘密洞穴的祭坛吻合，那个祭坛有三个钥匙孔，巧了一共有三个方尖碑，于是她有了一个大胆的想法。问题是她找不到替死鬼来继续打BOSS了。。。海伦娜听说有一个“兽群女王”，于是去找她帮忙：来自古代中国汉朝末年的黄巾将领，李美盈，也就是大家常说的挂B。
当时的孤岛并不太平，来自古罗马的涅尔瓦做着他的皇帝(服霸)梦，并且和李美盈产生了冲突。乘着海伦娜和李美盈打完大猩猩BOSS传送回来，涅尔瓦突然袭击，击杀了李美盈全部兽群(包括她最爱的坐骑，迅猛龙乌骓)，并俘虏了海伦娜。海伦娜无奈，交代了方尖碑和钥匙的秘密，这让隐藏在涅尔瓦军中的罗克韦尔不满(他认为海伦娜背叛了自己)。涅尔瓦带着部队打完喷火龙BOSS，集齐三把钥匙前往孤岛泰克洞，并且在和方舟“监察者”的战斗中惨胜。没想到李美盈突然袭击(以彼之道还施彼身)，击杀了涅尔瓦。
虽然他们一行人通关了孤岛方舟，但重回地球的程序并没有启动(因为地球上的腐化意识集合体已经生成了灭绝最终BOSS帝王泰坦，回归地球计划被无限期推迟了)。没有通关的喜悦，在一片混乱中，李美盈和涅尔瓦的尸体一起被传送往畸变方舟，海伦娜和罗克韦尔被传送往焦土方舟。
