它讲述着这样一个有趣的故事：从前有一个小男孩，大概十四岁左右，个子又高又瘦，长着一头浅黄色的金发。他喜欢睡觉和吃饭，游手好闲而且很爱调皮捣蛋。
一个晴朗的星期天的早晨，一只小狐仙来到男孩家偷东西。男孩想做个恶作剧，捉弄小狐仙，这使小狐仙非常生气。把男孩变得和小狐仙一样小。男孩走出家门，发现自己能和动物对话。因为他平时很爱欺负家里养的动物，现在动物们看见他这么小，便张口就骂男孩。
这时，一队大雁飞了过来，招唤着男孩家的雄鹅一起飞，而男孩发现家里的一只大雄鹅要飞走了，便马上跳到雄鹅背上，想阻止雄鹅飞走，可雄鹅已经和大雁一起飞上了天空。男孩紧紧地抓住雄鹅的羽毛，不让自己滑下来。在这次旅行中男孩学会了和动物和睦相处，并且帮助雁群成功脱险。最后和雁群告别时男孩又变回了人。
《尼尔斯骑鹅旅行记》中最经典的故事有帮助大雁群摆脱灾难，与狐狸周旋帮助雄鹅虎口逃生，帮助黑老鼠夺回家园。
