最后被后金(也就是清朝)消灭了。
后金对蒙古族早已是虎视眈眈,最终,在多尔衮的手里,统一了蒙古族各部落,使得整个蒙古草原,都纳入了后金的统治之中。蒙古末代可汗,孛儿只斤·额尔孔果洛额哲,献出传国玉玺,投降后金,蒙古帝国就此彻底灭亡。