1、实生根系
用播种进行繁殖策殖，由胚根形成的根系。
特点:有主根并且发达，根系在土层中分布较深，生理年龄较轻，生活力和适应性强，个体间有差异(主要是因为种了为杂合体)，特别是栽培品种，都不能用种了去进行繁殖。只有用做砧木的可以用种了进行繁殖，一般野生品种较多（小钉子、山梨、山杏）。
2、茎源根系
由扦插或压条形成的根系，为不定根。(葡萄、石榴、无花果）
特点:主根不发达，基本无主根，根系分布较浅。生理年龄较老，生活力和适应性较弱。个休问差异较小，能够保持母体的性状。
3、根孽根系
有些果树在根上可以发生不定芽形成根孽。与母体脱离后可以形成新植株个体。新独立个体形成的根系称为根孽根系。其特点同茎源根系。
