能够生长黑木耳的树种约120余种。选择哪些树种为好，必须根据当地的资源条件考虑。在众多的树种中，除含有松脂、精油、醇、醚及芳香类物质的松、柏、杉、樟等树种不适于生产黑木耳外，大多数的阔叶树种均可用来进行栽培。通常用来栽培黑木耳的有栎树、桦树、杨树、柳树、榆树、梨树、杏树、苹果树、刺槐、桑树及法国梧桐等树种。
在选树时，还要考虑树龄、粗度、材质、坡向和生长土质等因素。木质疏松的树种，吸水性和通气性较好，接种后出耳早、产耳年限短。木质坚硬的树种，通气和吸水性能差，接种后不易定植，若能定植，出耳亦晚，生长慢，但产耳年限较长。树龄小，树皮薄，则产耳年限短；树龄过大，养分不足，则出耳慢。一般应以8～10年左右的树龄，粗度在5～l0厘米左右为好。同时，生长在土壤肥沃和向阳坡上的树种，因养分足，生长快，边材大，心材小，木质松，栽培的黑木耳朵大，肉厚，产量高。所以，选树时，应根据实际情况进行综合考虑。
