茶卡盐湖形成的原因是由于青藏高原的逐渐隆起,部分海水积留在低洼地带,形成了许多盐湖和池塘,茶卡盐湖就是其中之一。
大约10~13万年前,茶卡盐湖还是一个外流湖,向东流入共和盆地、注入黄河,后来发生构造隆起,使得茶卡盐湖变成了内陆湖。