关闭电渗析进水总阀及流量计前的浓、淡、极水的进水阀门，打开浓、淡、极水管或电渗析本体的排气阀。
开启稳压水泵入口阀门、电渗析器浓、淡水排污阀门和极水泵入口阀门。当极水确定为密闭循环时，应开启极水箱回水总阀门和每台电渗析器的极水出口阀门。
当稳压水箱水位高于1米时，打开水泵回流阀，开启稳压水泵，缓慢开启出口阀门。启动极水泵，开启水泵出口阀门。
缓慢开启浓、淡水倒进水阀门，注意始终保持极水压力与波、淡水压力相适应，并使极水压力低于浓、淡水压力0.01MPa——0.02MPa，当浓、淡、极水压力升到0.05MPa——O.1MPa且稳定到一定流量时，待空气排尽后，关闭排气阀。
当淡水水质合格后，开启淡水回收阀门，关闭淡水排污阀门，开始正常运行。电渗析开始运行时，要先通水后供电，停止运行时，要先断电后停水，严禁停水不停电。开始和停止运行时，要尽量做到同时开启和关闭淡水、浓水和极水的阀门，以免水压突然变化产生水锤现象(水压冲击)。
13.严格控制电渗析器在极限电流下运行。
