菌盖下的菌褶部分或菌管部分会留下很多的泥巴，用一般清洗方法很难洗干净，菌柄部分由于相对较为光滑，所以相对于菌盖部分较易清理。可以尝试这样洗：1.
把菌柄和菌盖用小刀或手掰开,分别清洗,不要浸泡，否则菌子含水增加,会减少香味。
2. 把水开到最小,边刷边洗,先用牙刷轻轻洗去菌柄上的泥土，你会发现这个很容易做到。
3. 清理完菌柄后，再用牙刷轻轻洗去菌盖上的泥土，并同时把水开到最小,边刷边洗,
最后用牙刷刷去菌盖下面也就是菌褶上面的泥土，注意不要用力过度，否则蘑菇易碎，不成形。
4.接着反复漂洗，还是要先洗菌柄，后洗菌盖，这样可以达到节省用水的目的，直到洗干净为止!以上方法适用于大多数的蘑菇，如伞菌等。
如果你要清洗的是白参(裂褶菌)，就要用另外的方法：1.用剪刀剪去基部的木屑，粗拣，去掉杂物和杂菌。
2.用牙刷刷洗一次。
3.反复揉洗，去除上面的木屑细颗粒以及灰尘等杂物，直至水变清。
4.用开水把洗好的白参放入沸水中煮10多分钟，可去除其表面的霉菌。
5.煮好后用手捏干水分，放在簸箕上日光照射，直至完全晾干，这个时候就可以放入食品袋内保存，放食用时只需直接取出稍微清洗后，烹饪即可。但要注意选择天气晴朗的日子进行清洗，否则容易长霉。
