一个从出生身上就完全没有味道的男子葛奴乙，却是个嗅觉天才，他能制造出全世界最独一无二的杰出香水，这些香水的制作方式和一般的并无不同，唯一差别之处，是他所使用原料—处女的体香，只要是葛奴乙挑选中的女子，他便不计一切代价将她杀害，将新鲜的尸体身上的香味用来作成香水的材料，让这个香味永远只专属他一个人……。
1744年，法国，香都弥漫着难以想象的恶臭，肮脏杂乱的菜市场；一个男人将一筐鱼倒下，和一个同样浑身腥臭，湿头发披脸前的女人。片刻之后，这个女人突然表情痛苦，镜头转向她圆突的肚子。她倒在地上，使劲，然后伴着哗啦一阵水声，她用杀鱼刀剪断自己这部分脐带，踢开婴孩－－这就算生产完毕。有人前来，她吃力站起来，神情虚弱恍然，然而却真的似乎没有发生过什么一样。
那个婴孩躺在鱼堆上，肚子上的脐带，浑身的残血，让人看了可怕。他闭着眼，但是小鼻子抽动。四周的一切气味，鱼腥味，狗味，垃圾味……刺激着他天生无比灵敏的嗅觉。约一分钟之后，他终于睁开眼睛发出哭声。
人们开始寻找声源，通过鱼摊掩布的缝隙看到了这个才出生的婴孩，于是寻找孩子的母亲。
这是第一个因为他而死的人。第一个遗弃他的人。他的母亲。在他出生的那一刻遗弃他。不知道他吃什么度过生命最初那段时间。他竟然这样活了下来。他叫Jean-Baptiste Grenouille。
在襁褓里被送去孤儿院，刚到的夜里占了一个男孩半张床。这个男孩和其他几个孤儿打算闷死他。他的哭声吵醒了孤儿院太太，救了他，也让那些孩子吃了棒子。可以想象他慢慢长大，都是不受其他孩子欢迎的，于是他很大了才开口说话。而灵敏的鼻子早已让他和任何人不一样。他总是用力吸气，闻着各种新鲜的气味。也使用了一种特殊的方式学语言背单词－－用嗅觉。他甚至可以闻到很远以外池塘里的青蛙卵。
他把树枝，树叶，苹果放在一起闻，背后飞来一个果子，他闻到所以躲开，不知道那个砸果子的孩子会不会被吓到。他甚至闻死老鼠，闻到里面的蛔虫。
再大些，他被卖去码头当劳工。孤儿院太太却被抢钱的人杀死在几步之外的门口。这是第二个遗弃他然后马上死去的人。
Grenouille在码头干活，突然有天工头让他一起到巴黎市区送货。这一行，大开“鼻界”。各种各样新鲜的气味在城市中间向他飘来。他在香水店外隔窗闻了很久。店里生意兴荣，调香师在太太小姐面前晃动香水瓶，飘动滴着香水的手帕，她们则一片痴迷神情。尤其那蓝色瓶子里的香水，更是迷惑众人。
突然一股特殊的气味吸引了他，他寻香而去，跟踪一个红发少女的背影走过了几条街。他从未闻过这种香味--少女和她那篮柳橙。少女给了他第一份爱－－以为他想吃橙，伸手递给他两个－－这个善良的女孩，片刻前曾同样送给街边乞丐老太两个橙。
他说不出一个字，也没有接橙，却是捧住女孩的手，死命闻。女孩吓到，抽手转身逃走。而他那超能的嗅觉，哪怕跑了几里也能够寻找。
他找到她，从背后出现，继续闻女孩的背。女孩回头，吓了要叫，正好有人经过，他堵住她的嘴。
第三个因为他而死的人，第一个他杀的女孩。但是是误杀。
他愣住，那一刻他没有太多想法，既没有害怕，也没有伤心，他一时还没有接受现实。他舍不得那个充满神奇香味的身体。最终他解开她的衣服，嗅遍她全身，很用劲地嗅。最后，尸体冷却，香味不再，他开始不安。
回去工头那里，挨了一阵打。而那晚，他一直没有睡，他在思考。回味那少女的气味，思考不再存在的气味如何复制。
香水店没有一个客人，老板兼调香师在内打瞌睡。当年年轻有为的调香师已经江兰才尽，没有灵感，甚至嗅不出那蓝色瓶子里香水的配方。房子时不时地震般颤动一下。
一天夜里，Grenouille送一批皮料去香水店。他的鼻子第一时间闻过所有气味，辨认和记忆更在瞬间完成。
老板终于同意他试，只同意配一小瓶。他不认识那些瓶子里东西的名字，但是了解气味。很快，他配好，老板又惊又怒，他说他没有完，又加又配，然后说那才是出色的香水。老板闻也不闻赶他出门，但是同意考虑收他。
第二天，老板把他从工头那里买回。那个工头开心地拿着钱，却在桥上失足落水。第四个因为他而死的人。也是第三个遗弃他的人。
香水店因Grenouille东山再起。他实验着他的想法。老板教他各种基础常识，如何将原料（花草）煮沸再蒸得植物浆液，以及香水的前，中，尾三调。每个调4个小瓶子，但是需要非常与众不同的第13瓶压轴。这样的气味才能留得很久很久。
一天夜里他砸了很多东西，老板赶去看，他实验了丢各种东西进大锅炉（玻璃杯，皮料，甚至小狗！），但是什么气味也没有得到。老板告诉他，这些东西就是不会出来气味的，不存在的就是无法复制。就这么一句话，无法复制物体原有气味，竟让他立即晕倒，差点死去。老板很紧张他的安危，但是不是因为爱，是因为他给他带来很大利益。
他醒了，喃喃着也许可以换一种方式复制气味。他离开了，于是和老板达成协议。他留下很多香味配方。
老板拿着那本配方开心入睡，然后房子震动，这次是彻底倒塌。
这次，是他离弃老板，但是老板还是在他离开之后立即死去。
Grenouille需要远离大城市，找简单，纯净的环境去思考复制气味的方法。他需要复制那个不在存在的红发少女的气味。
没有地图，没有任何工具，靠着鼻子的辨别方向，岔路口凭着感觉选择。
他在一个山洞里住了很久，慢慢忘记了自己的计划。一天夜里，他梦到那个红发少女，他就站在她面前，而她却看不到他。他对她而言不存在。他醒来拼命闻自己，再冲进大雨中洗澡，再闻自己，还是什么也没有。他害怕自己就这样死去，然后没有谁记得他曾经存在过；更可怕的是，也许他根本就不曾存在。
他要继续他的计划，他要寻找和尝试他的方法。
又是一个红发美少女，因为这个美少女的体香，Grenouille来到这个小城。小城开始了不幸。他继续实验他的想法，煮了一个女孩，但是什么都没有得到。之后他花钱找妓女回来，想把发膏似的那个东西涂在她身上，然后用类似保险膜作用的布裹起来，隔上一夜再刮回来，这样会有女人的体味。结果那个妓女怕了，于是他开始了蓄意杀人。
小狗证明了他这次实验的成功。
这以后，接连12个女孩遇害，被发现时候都是被剪了头发的裸体。小城开始恐慌，骚动。
不过他的嗅觉太灵敏了，别人在哪里，在干嘛都不能逃过他的嗅觉。
那一排准备前、中、尾三调的小瓶子被装满。剩下最后一个。最重要，最特别的第13瓶香。那个红发少女一共逃过3次。她聪明的又极爱她的法官父亲要求搬家，知道那个坏人要在这些女孩身上得到什么才会完结。他预感最后这个人就是他最爱的女儿。
他还故意兵分两路，让仆人上女儿的马车，自己带着女儿单独逃跑。
父女二人在一个家庭旅馆住下，父亲将女儿锁在窗口对着海的悬崖的房间，自己在隔壁。但是，钥匙，居然放在床头柜！女孩不能理解父亲的做法，更觉得委屈。
夜里，Grenouille从房东的窗口爬进，他去父亲房间，拿走了女孩房间的钥匙。
第二天清晨，当父亲打开女孩的房门，女孩像其他女尸一样被剃了头发裸体躺在床上。父亲的哭痛彻心扉。不远的山坡上，Grenouille在专心蒸煮这最重要的第13瓶香。用最快速度加入已经调制好的香水里，藏进贴身衣袋。然后被捕。
女孩的父亲将Grenouille倒吊，置于水桶中再抽上来。他神情呆滞地苦苦逼问Grenouille，为什么要杀他的女儿。
一个伤心欲绝的父亲，苦求完全没有意义的答案，只因为他已经不知道缺失的生命要如何继续。
回去那个小城，全城人都恨他，都要看着他死－－那种叫嚣、那种痛恨。
可是，Grenouille把香水通过手绢点在自己的大动脉上。他用这瓶完美香水迷惑了所有人。
前调：人们感动地拜他，觉得这不是一个普通的人；
中调：人们迫切需要他的香味，得到时几乎要昏厥；
最后，他把那块滴了香水的水帕抛了出去。
尾调：人群全像着了魔一样，开始脱衣，开始乱伦。有异性也有同性，甚至三人，甚至神父。
Grenouille也嗅着这个香味。他自己也从前调走到中调再到尾调。人群踢翻一箱橙的时候，他想起最初那个红发少女。
这时，他的幻想里出现的是少女向他伸出手来，他们拥在一起……相爱相吻，身体接触，气味并和。
然而所有人都被香水迷惑了时，他却清醒。他清醒记得她僵硬地躺在地上，她死了，那个体香不再，眼泪滚下他的脸庞。
这瓶香水让人都有爱的错觉，就是让人得到最想要的。哪怕是幻境，也至少存在。所以那些人疯了晕了迷糊了，但是那个状态应该是幸福的。
唯独他，错觉只是片刻，始终清醒所以痛苦；他意识到他的爱已成风，于是绝望于是消失。
原来Grenouille还是有爱的。
第13瓶香的那个美少女的父亲向他走来，他也还清醒。可是当他走近，也还是跪倒在这个香味里，抱着Grenouille痛哭……因为失去儿子，无比珍惜女儿。当都失去，心已跟着死去。
这瓶香水让他得到他最想要的环境，所以他跪倒，抱住Grenouille哭……
Grenouille回到他出生的地方，在难民区那样的地方，将整瓶香水从自己头上倒下。那些身上破烂肮脏并且饥饿的人们冲来围着他，要吃掉他。对于这些人，最想得到的就是不再饥饿。他们闻着那个香味时候的神情就好似一块巨大的可口肥肉近在眼前。然后，他就这样消失。只剩下衣物和那个倒尽的空瓶，如同他出生之时，一无所有。
他至少来到世上做了一些事，出于爱（par amour）。
