淡水循环水养殖一般是针对高附加值的品种。如鳗鱼、加州鲈鱼、鳜鱼、宝石鲈、光唇鱼、娃娃鱼等的高密度养殖。利用循环水养殖系统设备对水质进行处理，达到减少污染、提高产量、优化品质、反季节销售的目的。而普通的罗非鱼及四大家鱼，因为市场价格的因素，做循环水的必要性不强。
淡水循环水养殖系统的主要目的就是将水质指标中的温度、溶氧度、氨氮、亚硝酸盐等主要因素控制在合理范围内。因为淡水盐度较低，所以在应用中不使用蛋白质分离器等过滤器。而使用袋式过滤器等设备。在经过微滤机的过滤后，水中大颗粒的有机物已过完全过滤，再经过比较精密的袋式过滤器。绝大部分的固体颗粒都被过滤干净。低于10微米的有机物中，包含了一些有益的藻类等物质。
在经过热泵或冷水机的温度处理后，再经过紫外线杀菌器。对水中的菌类特别是有害细菌和病毒进行杀灭。水再注入生物过滤器中。
因为生物过滤器的要求相对比较苛刻，有益的硝化细菌等培养周期较长。可以在生物过滤器里定期定量加入一定的有益菌进行调节和干预。即便如此。生物过滤器的处理能力也往往受限。因此我们建议将鱼菜共生系统嵌入淡水循环水养殖系统中。水培植物发达的根系不仅可以从水中吸收氨氮、亚硝酸盐等对鱼虾有毒的物质，而且也可以作为有益菌附着挂膜的载体。水培植物定期收割，就可以使水中不断加入的氮元素彻底从水中分离出来。
溶氧系统一般是根据养殖密度的情况而定。如果养殖密度不大，普通的风机加曝气管就可以胜任。如果养殖密度特别大，可以使用气液混合与氧气瓶组合增氧。
系统不要求是完全无菌的环境。完全无菌的环境对水产生物来讲是致命的。因此，没必要追求完全无菌的环境。但把有害细菌或病毒控制在一定浓度之内，有效减少水产生物的发病概率、做到系统可按是十分必要的。因此，紫外线杀菌器是较好的选择。
蓝灵水处理在设计淡水循环水养殖系统时，会非常看重系统的耗电量等成本问题。在尽量减少管道的同时，也尽量减少水头的落差。设备配套合理，减少能量的浪费也是系统设计的核心要点。
