零余额账户的意思是指财政部门为本部门和预算单位在商业银行开设的账户，用于财政直接支付和财政授权支付及清算。零余额账户是实现对预算资金最终付款控制的必要的技术手段。
设置方法
省级一级预算单位及无主管部门的行政事业单位，须填写《银行账户审批表》报省财政厅（基层预算单位填写《银行账户审批表》，报主管部门，主管部门还须填写《财政授权支付银行开户情况汇总申请表》，连同基层预算单位的《银行账户审批表》一并报省财政厅）；《银行账户审批表》经省财政厅审批后报人民银行，人民银行按规定核发《开户许可证》，预算单位持《开户许可证》，在省财政厅确定的代理银行所属分支机构内，自主选择预算单位零余额账户的开户银行，办理零余额账户开户和印鉴预留手续。
预算单位在改革实施前已由财政拨付的资金，继续在原开设的银行账户中使用和核算；原账户中相关用途的财政资金使用完毕后，从新开设的预算单位零余额账户中按规定支用有关款项。
