氧化磷酸化：伴随生物氧化而进行的腺苷三磷酸（ATP）的生成作用。糖酵解和三羧酸循环产生的还原型辅酶I（NADH2）和还原型黄素蛋白（FADH2），不能被直接氧化。它们中的氢，包括氢离子（H+）和电子（e -），都要通过一系列电子传递体（包括细胞色素b、c、a、a3等）的传递，最终才能传递给氧。只有氧活化后，才能和氢结合生成水，这些电子传递体在传递电子的过程中，它们的能量水平将逐步下降。所释放的能量一部分推动着磷酸化作用，使ADP和无机磷酸结合生成ATP。由于氧化作用和磷酸化作用同时进行，故名氧化磷酸化。
2.光和磷酸化：光合磷酸化(photophosphorylation)是植物叶绿体的类囊体膜或光合细菌的载色体在光下催化腺二磷（ADP）与磷酸（Pi）形成腺三磷（ATP）的反应。有两种类型：循环式光合磷酸化和非循环式光合磷酸化。前者是在光反应的循环式电子传递过程中同时发生磷酸化，产生ATP。后者是在光反应的非循环式电子传递过程中同时发生磷酸化，产生ATP。在非循环式电子传递途径中，电子最终来自于水，最后传到氧化型辅酶Ⅱ（NADP+）。因此，在形成ATP的同时，还释放了氧并形成还原型辅酶Ⅱ（NADPH）。
