1、机身尺寸不同。
iPhone 6s采用4.7英寸1920*1080像素屏幕，1334 x 750 像素分辨率，326 ppi，1400:1 对比度 (标准)；iPhone 6s Plus采用5.5英寸1920*1080像素屏幕，1920 x 1080 像素分辨率，401 ppi，1300:1 对比度 (标准)。
2、摄像头像素不同。
iPhone 6s采用前置500万，后置1200万像素的摄像头；iPhone 6s Plus采用前置500万，后置1300万像素的摄像头。
3、电池容量不同。
iPhone 6s屏幕小，所以只内置了1715mAh电池，而iPhone 6s Plus屏幕稍微大了一些，因此内置2750mAh电池容量，续航能力基本没有区别。
苹果6s和6splus区别如下：
一、细节方面的区别（一）
1、新一代iphone6s和iphone6s Plus依旧延续了上一代的设计风格，这两款机子在屏幕方面有所不同，一个是4.7英寸，一个是5.5英寸大屏．而在性能方面iPhone6s与iPhone6s Plus均是搭载了苹果最新的A9芯片处理器，2GB运行内存和16GB/64GB/128G组合。
2、iPhone6s和iPhone6s Plus屏幕底部依旧是指纹识别Home键，不过此次带来的是指纹识别2.0技术，使得指纹体验方面相比上一代有所提升，另外iPhone6s和iPhone6s Plus在屏幕方面加入了3D Touch功能。
3、前置摄像头方面，iPhone6s和iPhone6s Plus均采用了1200万像素的前置摄像头，具备f/2.2最大光圈，背照式CMOS。另外考虑到镜头安全性问题，此前的蓝宝石镜头变成了双离子交换工艺的高强度玻璃。但值得一提的是，iPhone6s Plus后置摄像头加入了光学防抖功能，而iphone6s是没有这个功能的。
4、机身配色方面，此次iphone6s其中最大变化之一就是加入了玫瑰金配色，因此一共有四种机身配色。
