1、老人、儿童难操作
智能马桶盖的一侧往往配有一个按钮繁多的操作面板，或是配有一支按钮更为繁多的遥控器。这就无疑为老人、儿童增加了操作难度。如果误操作，也许无法顺利达到喷水、加热、除臭等效果，甚至还可能造成产品本身电路故障。
2、盖板不适用所有马桶
虽然马桶盖集智能、人性化、科技感、设计感于一身，但并不是所有的马桶都适用。目前主流智能马桶盖产品均面向圆弧形马桶，而与方形马桶配套的盖板比较罕见。其次，智能马桶盖对水箱到便座前端距离、安装孔间距离等具有限制，如果消费者家用的尺寸超出了所允许的区间范围，则无法顺利安装智能马桶盖，这意味着要么更换马桶、要么无法使用。
3、维护成本高
智能马桶盖其内部电机和集成电路等具有较高的科技含量，因此前期一次性投入成本较高。另外，超出了保修期限的智能马桶盖，一旦出现问题则意味着消费者要自费进行修理，如果产品需要更换核心部件，也意味着一笔不菲的支出。
