禅寺和寺院是一样的，禅寺都属于寺院一类，但由于佛教传入中国，慢慢的形成了十大流派：禅宗、天台宗、华严宗、密宗、法相宗、律宗、三论宗、净土宗、俱舍宗、成实宗。因此，不同的流派就将寺院与宗派挂上名来，以示尊重及区别，譬如律宗的寺院：江西德兴市静住律寺；修禅宗和净土宗的比较多，所有又有“禅寺”的称呼。
禅寺，又称为丛林、禅宗寺院，是中国佛教禅宗的修行道场。 禅寺通常指禅宗寺院而言，故亦称禅林，但后世教、律等各宗寺院也有仿照禅林制度而称禅寺的。中国禅宗从曹溪惠能后，四传至于怀海，百余年间禅徒只以道相授受，多岩居穴处，或寄住律宗寺院。到了唐贞元、元和间（785～806），禅宗日盛，宗匠常聚徒多人于一处，修禅办道。江西奉新百丈山怀海以禅众聚处，尊卑不分，于说法住持，未合规制，于是折衷大小乘经律，创意别立禅居，此即禅寺之始。
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禅寺制度
1、禅寺制度，最初只有方丈、法堂、僧堂和寮舍。以住持为一众之主，非高其位则其道不严，故尊为长老，居于方丈。不立佛殿，唯建法堂（后世乃立佛殿）。
2、所集禅众无论多少，尽入僧堂，依受戒先后腊次安排。行普请法（集体劳动），无论上下，均令参加生产劳动以自给。又置十务（十职），谓之寮舍；每舍任用首领一人，管理多人事务，令各其局（《景德传灯录》卷六《禅门规式》）。
3、在这以前寺院的首脑为三纲：即上座、寺主、维那（或称都维那），都是领导大众维持纲纪的职僧。上座以年德俱高，都是朝廷任命。如姚秦、元魏，常有命令补上座。
4、唐道宣亦曾被命为西明寺上座，其位居寺主、维那之上。寺主知一寺之事。如后周陟岵寺、隋大兴益寺等，皆有寺主。维那意为次第，谓知僧事之次第，或称为悦众；但后世常以悦众为维那之副，其职有数人，以大、二、三、四等别之（《百丈清规证义记》卷六）。
