航天五院下设13个研究所和卫星制造厂，分布在全国七个省市。
各分所位置及业务如下:
501所 北京空间飞行器总体设计部（北京）
502所 北京控制工程研究所（北京）
503所 北京卫星信息工程研究所（北京）
504所 西安空间无线电技术研究所（航天五院西安分院）（西安）
508所 北京空间机电研究所（北京）
510所 兰州物理研究所（兰州）
511所 北京卫星环境工程研究所（北京）
512所 北京空间科技信息研究所（北京）
513所 山东航天电子技术研究所（烟台）
514所 北京东方计量测试研究所（北京）
515所 汕头电子技术研究所（北京）
518所 天津航天机电设备研究所（天津）
