《藤野先生》全文共38个自然段,分段及段意为:
第一部分(第1-3自然段):东京见闻,交代见藤野先生的缘由。
第二部分(第4-35自然段):写在仙台与先生的相识、相处和离别。
第三部分(第36-38自然段):离开仙台,叙述作者对藤野先生的怀念。