牡蛎可以通过冷冻和真空保鲜的方式长期保存。将新鲜的牡蛎洗净后，用抹干的纸巾或厨房用纸来吸干水分。
将牡蛎尽量放在一层一层的密封袋中，或直接将牡蛎放入真空包装袋中，封好后放入冰箱的冷冻室中，保存时间可以达到6个月。当要吃的时候，将牡蛎从冰箱中取出，解冻后即可煮食。在真空保鲜和冷冻过程中，注意不要过度压缩，否则容易损伤牡蛎的营养成分。
冷藏法:把牡蛎浸泡在盐水里大约一个小时后，用食用碱清洗几遍，再用保鲜袋装好，放在冰箱里冷藏。
盐渍法:把牡蛎用盐拌均匀后放在冰箱里保鲜。
晒干法:把牡蛎晒干之后放置于干燥处保存。
