部门分工不均会导致，部门之间不团结，工作不配合，有些部门会过度强调自己部门的重要性，以自己部门为中心，没有全局意识，不懂顾全大局，有些部门感到不受重视，人心涣散，这样的单位形成不了战斗力，不能拧成一股绳，更不会齐心协力去完成整体工作。
部门分工不均会导致相关管理工作得不到有效开展，会不同程度影响部门的日常运作和综合竞争力。
部门分工不均的问题很复杂，部门所在行业与发展阶段、部门领导者的管理风格、部门可用的人员等因素都会对它产生较大影响，很难有一个统一的标准。但总的原则是部门职能划分要合理，要尽可能清晰。否则在职能模糊地带会出现管理盲区或扯皮现象，进而影响部门团结。
