1、外观区别
小龙虾的外壳有着明显的甲刺和突痕，副足较粗，头部较大，第一对螯比较修长而且有着明显的甲刺。蝲蛄的外表更加光滑，没有明显的凹凸和甲刺，除此之外，副足修长，尾部更大，第一对螯更加光滑饱满。
2、分类区别
小龙虾属于十足目、螯虾科、原鳌虾属，而蝲蛄属于十足目、河虾科、蝲蛄属。蝲蛄又叫做东北小龙虾，是河虾的一种，在民间多叫它大头虾，或者是鳌虾，就是因为它的外形很像龙虾，但是个头小很多。
3、生长环境区别
小龙虾对栖息水域环境要求不高，适应能力更强，可在轻微污染水体中生活。蝲蛄却对水质要求极高，它只在一些水质清澈且没有污染的溪流、河川中才有。如果水质稍微受到一点污染，尤其是对化学、农药等非常敏感，就会性命垂危，并且极有可能全部死亡。在过去蝲蛄还被当成水质检测的标准之一，如果水域中有蝲蛄，就表示这个水质很好，是可以直接当饮用水的。
4、口感区别
小龙虾虽然都是养殖的，即便是养殖的环境好，这样的小龙虾还是有泥腥味的，如果不清洗干净的话更严重。而蝲蛄则不一样，它对水质要求高，基本没有什么异味。简单的烹饪一下，是非常鲜美的，味道要比小龙虾更好吃。
5、价格区别
蝲蛄的价格可比小龙虾贵不少了。从几十年前几块钱一斤涨到几十元，如今更是要一两百元一斤，据说在有些地方还突破200元一斤了。即便是如此高的价格，在市场上也难以见到。而小龙虾的价格是便宜的，特别大量上市的时候，也就十几元一斤
