嗜热链球菌
酸奶大多都含嗜热链球菌，它是一种革兰氏阳性菌，除了能增强免疫力外在生产酸奶的过程中也有重要作用。
嗜热链球菌能生成一种可以分解乳糖的酶并产生一种多糖，这会使酸奶更加粘稠，而且容易凝固。
保加利亚菌
保加利亚菌也常出现在各种酸奶广告中，它也是一种乳酸菌，可将乳糖分解生成葡萄糖与半乳糖，然后生成乳酸，增添酸奶的风味和口感。
保加利亚菌还能分解牛奶中的一些大分子蛋白，生成更易被消化的氨基酸。

双歧杆菌
双歧杆菌在酸奶包装中也比较常见，它能通过磷蛋白磷酸酶分解α-酪蛋白，生成更容易被人体吸收的氨基酸。
