大樱桃的花芽分化也包括生理分化期和形态分化期两个阶段，虽然花束状果枝和短果枝上的花芽在硬核期就有开始分化的，但毕竟数量小。果实采收后10天左右，花芽开始大量分化,整个分化期需40~45天完成。叶芽萌动后，长成具有6~7片叶簇的新梢的基部各节，其腋芽多能分化为花芽，第二年结果。
而开花后长出的新梢顶部各节，一般不能成花。在进行摘心或剪梢处理的树上，二次枝基部有时也能分化成花芽，形成一条枝上两段或多段成花的现象。
在烟台，过去大樱桃的花芽分化期一般在6月末至7月上旬，7月中旬结束，近几年气候变暖，开花较早，果实成熟提前，所以分化期也提前。
2年生的花束状果枝比1年生的早1周左右。那翁品种的花束状果枝的花芽生理分化期在采果后10天左右，而形态分化期在采果后1~2个月的时间里。
7~8月份是大櫻桃花芽形态分化的关键时期，若营养不良，会影响花芽质量，甚至出现雌蕊败育花。这一时期在胶东地区一般是高温多雨季节，但遇高温、干旱的年份，常使花芽发育过度，出现大量双雌蕊花，形成畸形果，影响果实商品性。
