明代《辽东志》所收录了一幅《盖州卫境图》，在今鲅鱼圈位置上标有“深井墩”字样，也就是今墩台山烽火台，鲅鱼圈至今仍有神（深）井子村，可见明代此地名为“深井子”。
清顺治十二年（1655年），清政府下令：“沿海省份，应立严禁，无许片帆入海，违者立置重典。”顺治十八年（1661年），清政府又厉行迁海政策，派出大量官员到各地监督迁移，沿海居民被强行内迁三十里，那个时候的鲅鱼圈是荒无人烟的。海禁一直到康熙二十三年（1684年）方才解除。因此鲅鱼圈名字的确立不应早于这个年份。
1930年版的《盖平县志》中有“……此外尚有三五渔港，曰西套、曰望海、曰鲅鱼圈，皆属风帆小港非交通海口也。”这是记录的鲅鱼圈最早的典籍。
