南通大学与扬州大学相比，扬州大学更好。扬州大学学科建设更丰富、院系设置更多、师资力量更雄厚。
南通大学（Nantong University）始建于1912年，源自近代著名实业家、教育家张謇先生创办的私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校。2004年，原南通医学院、南通工学院、南通师范学院三校合并组建新的南通大学。学校是江苏省人民政府和交通运输部共建的综合性大学，江苏高水平大学建设高峰计划建设高校。在中国管理科学研究院《2023中国大学评价》中列第102位，ESI中国高校综合排名列第113位，2020软科中国大学造就杰出医学校友排名列第33位。
一个多世纪以来，学校秉承“祈通中西，力求精进”的校训精神、“学必期于用，用必适于地”的办学理念、“道德优美，学术纯粹”的价值追求，锐意进取，砥砺前行，现已建设成为一所规模结构合理、学科门类齐全、教学质量优秀、办学效益明显的地方综合性大学。1977年恢复高考以来，共有3名本科毕业生入选两院院士，人数并列全国高校第35位。
学校设有20个学院、1个独立学院（杏林学院）、1家直属大型综合三级甲等医院（南通大学附属医院）和国际教育学院、继续教育学院。拥有基础医学、临床医学、信息与通信工程3个博士后流动站，基础医学、临床医学、信息与通信工程、公共卫生与预防医学、特种医学5个一级学科博士点，23个一级学科硕士点，19个硕士专业学位点。临床医学、神经科学与行为学、工程学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、化学、材料科学、分子生物与遗传学、计算机科学等9个学科进入ESI学科全球排名前1%。拥有江苏高校优势学科2个、江苏省重点学科8个、江苏省临床医学重点专科30个。
扬州大学坐落于国家首批历史文化名城扬州，是江苏省人民政府和教育部共建高校、江苏省属重点综合性大学、江苏高水平大学建设高峰计划A类建设高校，全国首批博士、硕士学位授予单位，全国率先进行合并办学的高校。学校前身是1902年由近代著名实业家、教育家张謇先生创办的通州师范学校和通海农学堂。1952年全国院系调整时，其农科和代办的文史专修科西迁扬州，组建苏北农学院和苏北师范专科学校；其他4所院校也在同时期相继在扬建立或迁来扬州办学。1992年，学校由扬州师范学院、江苏农学院、扬州工学院、扬州医学院、江苏水利工程专科学校、江苏商业专科学校等6所高校合并组建而成。
学校学科门类齐全，涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12大学科门类。全校普通全日制本科生30700多人，各类博、硕士研究生16200多人。现有一级学科博士学位授权点21个，一级学科硕士学位授权点53个，博士专业学位类别3个，硕士专业学位类别31个，博士后流动站20个；拥有国家级重点学科2个，国家重点（培育）学科1个，省优势学科7个，“十四五”省一级学科重点学科10个，化学、植物与动物科学、工程学、农业科学、临床医学、材料科学、计算机科学、生物学与生物化学、药理学与毒理学、环境生态学、微生物学、分子生物学与遗传学等12个学科的ESI排名进入全球大学和科研机构前1%。
学校人才培养能力持续提高。建有国家级一流本科专业建设点41个，国家级特色专业6个，江苏高校品牌专业建设工程一期项目6个、二期项目41个，首批国家级现代产业学院1个，国家级人才培养模式创新实验区2个，省级优秀研究生工作站22个，教育部卓越人才培养项目8个，24个专业通过工程教育、临床医学及师范类专业认证和评估。拥有国家级一流本科课程39门，国家级精品课程14门，国家级精品资源共享课13门，教育部精品视频公开课2门，国家级双语教学示范课程1门，国家精品在线开放课程5门，国家级教学团队3个，教育部、农业部农科教合作人才培养基地2个，国家级校外实践教学基地1个，国家级实验教学示范中心1个，国家级虚拟仿真实验教学中心1个，国家级示范性虚拟仿真实验项目5项，获国家级教学成果二等奖4项、省高等教育教学成果特等奖6项和中国学位与研究生教育学会研究生教育成果奖二等奖1项。学校着力提升专业建设水平，实施扬州大学本科专业品牌化建设与提升工程，大力推进通识教育改革，深化创新创业教育，强化实践育人，积极打造“一院一品”，实行第二课堂学分制，推动第一第二课堂融合发展。学校混合教学改革案例入编联合国教科文组织《混合学习白皮书》，连续七次捧得全国“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛“优胜杯”，多次荣获全国“挑战杯”大学生创业计划竞赛金奖并捧得“优胜杯”，荣获中国“互联网+”大学生创新创业大赛金奖3项，获评全国首批深化创新创业教育改革示范高校、全国实践育人创新创业基地、全国创新创业典型经验高校。2004年以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估，2016年顺利通过教育部本科教学审核评估。
学校师资质态持续优化。全校现有教职员工6000多人，其中专任教师2900多人，医护人员2200多人，具有高级职务教师150
杨大好。
扬州大学（Yangzhou University），简称“扬大”，坐落于中国历史文化名城扬州，是江苏省人民政府和教育部共建高校，江苏省属重点综合性大学，江苏高水平大学全国百强省属高校建设计划支持高校，江苏省综合改革试点高校，全国首批博士、硕士学位授予单位，江苏-澳门·葡语国家大学合作联盟、江苏·英国20+20高水平大学合作联盟成员，入选国家建设高水平大学公派研究生项目、国家“特色重点学科项目”建设高校。
