甲鱼主要以肺呼吸，但当水温低于15℃时，甲鱼就潜入池底淤泥开始冬眠，
一直到气温好转之后，他才出来，它在冬眠的时候是靠喉咙部的鳃状组织等辅助呼吸器官进行呼吸的（这时候肺就没用了），所以不用上岸呼吸，
甲鱼有冬眠习性。杭嘉湖地区每年11月中旬到次年的4月中旬前后是甲鱼的冬眠期，当水温降到12℃时，甲鱼就潜入池底淤泥开始冬眠。冬季水溶氧量比夏季大、甲鱼休眠期呼吸微弱，所以只靠喉咙部的鳃状组织等辅助呼吸器官进行呼吸就可以满足生存的需要。 甲鱼冬眠也就潜到10到15厘米深的泥沙中，那里不缺少水溶氧。水底以下1米深的泥土中空气几乎不能存在。
