曲阜三孔在文化大革命开始的1966年被破坏的。这一年的11月，北京师范大学以谭厚兰为首的造反派窜到曲阜，发动了所谓的讨孔运动，他们捣毁孔庙，破坏孔府，孔林和鲁国遗址等文物古迹，使三孔遭受到了严重的损坏，造成了不可弥补的损失。
曲阜三孔被破坏是指2000年12月6日—13日，山东省济宁市曲阜市的世界文化遗产遭当地管理部门在清洗当中破坏的事件。又称“水洗三孔″事件。
曲阜市负责“三孔”文物旅游景区管理的市文物旅游服务处，在对孔庙、孔府、孔林进行水洗。致使古建筑木结构进水，壁画、殿堂彩绘、金箔脱落，石碑的石隔内渗水，展室文物字画和金属器物的安全面临潜在威胁。
曲阜“三孔”文物遭到大面积严重破坏，造成的损失难以估量。是一起典型的文物受损责任事故，事件发生后，国家对责任人进行了严肃处理。
