万历皇帝之所以不上朝主要原因之一就是当他自己慢慢掌握政权，他就发现看起来拥有无边无尽权力的皇帝，其实在很多的时候都受到了文武百官的限制即使已经废除了丞相，但是还是有很多的大臣组成了一个集团来制约皇权，这不是他想要的生活，他想要自由，他想要他的治治国之道得到很多人的支持。在前期的时候他确实为了自己的这种理想去奋斗，但是到最后他却发现这种奋斗似乎并没有什么效果，于是他开始为了宣泄不满就不上朝
第2个原因就是在明朝的时候虽然对于人的思想有一定的限制，但是不知道为什么在明朝言官特别的盛出，常常一个言官为了让皇帝听取自己的意见就进行死谏而且前赴后继，万历皇帝他希望自己能够统帅所有的人，而不是被这种人来制约。而且因为言官的盛行很多时候他们只是为了沽名钓誉而进行捕风捉影。这种做法对于国家来讲没有任何的促进作用，这让万币觉得力不从心想要逃避这种现实。
第3个原因就是在明朝的时候罂粟被广泛地种植了，那时候就已经制作成为鸦片流传流传到市场当中，万历皇帝也吸食了这种鸦片就开始变得堕落和沉迷于美色。为了能够满足自己的欲望他常常就进行选秀，根据史料记载他曾有一次一天娶了9个媳妇。
第4个原因是在21世纪我们挖出万历皇帝的墓穴而得到的结论，在万历皇帝的棺材内我们看见他的尸骨复原图得知，他的右腿与左腿是不对称的，这就说明这位皇帝他在生前的时候不良于行，这就导致他每天很难上朝这种身体状况不适合他出席活动。
通过对定陵万历皇帝遗骨的检测，发现万历皇帝有严重的驼背，而且还是个瘸子，或许身体的疾病才是他三十多年不上朝的原因吧。
